本校配合教育部高教深耕計畫政策，提出整體的發展計畫規劃如下：

　　為提升計畫品質及未來執行效益，本校訂有「高教深耕推動委員會設置辦法」，並編設「高教深耕計畫執行總辦公室」，由教務長擔任辦公室主任、副主任則由研發處、產學處、圖資處各一位長官擔任，且編設執行長、副執行長、行政管理組組長與績效研考組組長，專責高等教育深耕計畫各項業務的推動；另設六位召集人負責各構面、專章計畫的規劃、設計與推動，各組依其計畫內容邀請教學單位或行政單位共同參與計畫的研擬與討論。此外，為顧及整體高教深耕計畫構思的完整性與特色，另訂有「高教深耕諮議委員會設置辦法」，由校內外專家學者組成，提供建議以精進計畫品質。（本校高教深耕計畫執行總辦公室架構如下圖所示）。

  高雄醫學大學推動高教深耕計畫組織規劃

　　為確保高教深耕計畫執行成效與品質，本校採PDCA循環模式：計畫（Plan）→執行（Do）→查核（Check）→實施（Action）四大流程進行計畫管控。而為達成計畫目標，由高教深耕計畫執行總辦公室依據計畫之質量化績效指標，定期追蹤及了解各構面計畫執行進程，並定期召開會議檢討計畫執行成效。目標管控重點為各分項計畫之質量化績效指標落實與達成，進行目標管控策略如下：

(一) 各構面計畫分層負責及管考：由各構面召集人負責督導，強化計畫內溝通與執行。

(二) 高教深耕計畫各式管考會議：

1.月報會議：由辦公室執行長召開，邀集各構面/核心議題計畫專任人員參與，管控各構面計畫執行狀況、關鍵績效指標（KPI）達成情形，及經費使用結報進度等，                  並溝通協調各核心議題推動窒礙問題的解決。

2.雙月報會議：由校長召開，邀集各構面、核心議題主管與各學院院長共同針對計畫執行成果、經費使用與工作窒礙共同研商並取得共識。

3.執行總辦公室會議：由辦公室主任召開，除追蹤計畫執行進度外，更針對計畫執行困難進行跨單位協商，並定期陳報首長知悉。

4.推動委員會：由校長召開，針對計畫執行進度、績效管制、執行窒礙的處理、成效回顧、新一年度的深耕計畫規劃方向、經費及人力整體運用等，進行全面性的討                      論與體檢，提出精進意見。

前述會議均有完整記錄與追蹤管考，其執行檢討結果亦作為計畫未來執行改善或調整績效指標之參考，以持續精進本校高教深耕計畫執行效能與品質。