111年度高雄醫學大學高等教育深耕計畫
構面二-核心議題三
「聚焦特色研究與人才培育」
活動名稱 |
高通量單細胞分析與高維度組織蛋白體分析 |
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活動日期 |
111年09月14日(星期三)-111年09月15日(星期四) |
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活動時間 |
8:00-17:00 |
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活動地點 |
國研大樓八樓IR810共同實驗室&勵學大樓三樓半視聽中心 |
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活動參與對象 |
博碩士及大學部高年級學生、教師及附院同仁 |
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活動參與人數 |
兩日共60人 |
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一、 活動重點及目的: 【細胞】為生物體中有生物意義的最小單元,生物行為與反應即為多個細胞累積與交互影響後的整體表現。因此,了解生物體中個別細胞的基因表現與細胞特徵,對於準確得知細胞反應有其重要性。【Single cell NGS】是目前生醫領域強大的工具之一,結合分子條碼和生物資訊學分析工具,完成單細胞轉錄體基因表達和多體學之研究,用於探索組織或器官異質性,新型靶標和生物記等。 本次研習課程安排技術介紹、實驗導覽與數據分析,提供參與學員了解由實驗樣本製備到數據分析一系列完整介紹。藉由實驗流程操作帶領學員了解樣本製備注意事項、樣本品質參數,提供實驗技巧說明減低操作門檻。而後提供單細胞轉錄體數據分析介紹,由原始資料評估到系統化分析跨樣本的細胞次分群差異,如何有效的透過軟體分析取得樣本間差異化的代表性基因,並透過視覺化呈現單細胞資訊、擷取樣本代表性基因熱圖。 二、 活動特色及執行情形: 本研習課程邀請: 【世基生物醫學股份有限公司】之產品主任及應用科學家,安排軟體分析與技術應用經驗分享,帶領學員從單細胞平台介紹、實驗操作流程演示,到了解10x Genomics single cell RNA-Seq數據,及利用互動式軟體進行資料分析。完成本課程能夠熟悉常規單細胞實驗的實驗規劃與獲得初步數據分析概念。透過產業界之實作工作坊,藉以提供實際操作流程與資料分析工具提昇生物醫學研究能量。此一課程將能大幅提高參與學員具有規劃細胞樣本進行單細胞實驗與數據分析的能力,使學員: 1. 了解單細胞實驗原理,技術平台之操作建議與實驗流程中品質控管基準。 2. 藉由教學及實際操作,使參與學員了解透過互動式生物資訊工具了解分析策略與歸納差異化基因表現。 3. 藉由進階分析建議、演示,了解實際進行數據彙整與文獻發表需求之視覺化工具。 4. 參與學員學會實機操作10x Genomics single cell,學習全套實驗流程及相關注意事項,產出高可靠性與高再現性的研究分析實驗結果。 5. 培養及加深參與學員之研究能力,並能接軌至國家重點發展之生醫產業及醫療發展。 三、 活動之質量化指標: 課前問卷統計:參與動機89.64分,專業能力68.73分 課後問卷統計:參與動機94.55分,專業能力94.32分 (一)前測問卷 填答人數:33人
(二) 後測問卷 填答人數:22人
(三) 學員意見回饋: n 本次課程更進一步單細胞定序操作的方式,且透過儀器及實驗分析之實際操作教學讓人感到印象深刻,尤其操作小細節亦講解仔細,且經過整討實驗之實際操作後,可更加強先前的文字理論資訊。 n 應用科學家之講解說明實驗後的分析軟體應用及單細胞數據的分析及資料庫比對應用上,講解詳細易懂,透過自己電腦實際操作易讓人印象深刻。 n 希望在課程上可以安排定序分析相關課程,且在課程上可以減少使用專業用語,提供更基礎的應用課程,也希望未來可以將課程盡量安排在寒暑假期間,減少課堂衝堂而無法參予課程。
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(四)活動花絮: |
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學員上課畫面 |
學員上課畫面 |
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學員上課畫面 |
學員上課畫面 |
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