一、 活動重點及目的：

次世代定序屬於高通量技術，為生物醫學領域挹注了龐大的生物大數據，除了能提供單基因致病的快速定位外，更蘊含著探討多基因、多位點變異等複雜疾病的高通量資訊。但由於資料龐大，在資料分析時常造成生物背景的研究者的困境。本課程安排實際研究成果與技術應用經驗分享，帶領各位學員從了解定序數據分析方法與應用成果開始入門，進一步透過實機操作學習RNA-Seq等數據分析流程與其使用之方法，分析完成後再利用生物資訊及公共資料庫進行大數據之進階分析。期望讓研究者在實務概念與技術都能一次獲得，並大幅提升本校研究生在轉譯醫學和精準醫療的研究能力。

二、 活動特色及執行情形：

本研習課程邀請：

1.     【科技部生物資訊核心中心】頂尖學者，講授高通量之次世代定序原理、實務和演進，並教導參與學員如何處理這些高通量的數據及利用各種生物資訊軟體及資料庫進行運算和分析。

2.     【圖爾思生物科技股份有限公司】，安排技術應用經驗分享，帶領學員從了解單細胞技術介紹，進一步了解10x Genomics single cell RNA-Seq數據，及利用公共應用軟體之資料分析，最後再介紹基於此方式挑選細胞分群後利用生物資訊進行後續的延續分析。

3.     【創源生物科技股份有限公司】講解利用QIAGEN所開發針對變異位點數據進行位點註解與篩選，並示範如何提供藥物資料之線上軟體癌症基因體高通量數據視覺實作，以及如何利用VCF或Excel資料轉換成MAF格式並以Maftools之R語言套件進行變異位點視覺化。

透過學界與產業界之經驗，藉以提供更有力的證據來支持生物醫學研究。此一課程將能大幅提高參與學員具有高速及大量分析研究或臨床病人檢體之能力，使學員:

1.     了解次世代定序原理，不同分析平台之優缺點、技術平台之演進及未來發展方向，產出數據之意義及於臨床檢測之進階應用

2.     藉由教學及實際操作，使參與學員了解立用GSEA分析轉錄體生物路徑分析法

3.     本課程在新世代生物資訊分析豐富的實戰經驗與所建置的分析平台，提供基礎理論、實際應用到進階實機操作。讓參與學員在往後對於基因體數據具有能力判別及進行分析，不再錯誤解讀或一籌莫展

4.     藉由高通量的次世代定序方式，快速尋找出疾病相關之基因突變及生物標誌及藥物作用之標的及相關機轉

5.     提升參與學員對於各種檢體之保存、處理及分析之能力

6.     參與學員學會實機操作生物醫學數據處理與圖表製作，學習自動化資料處理與分析的方法，產出高可靠性與高再現性的分析結果。

7.     培養及加深參與學員之研究能力，並能接軌至國家重點發展之生醫產業及醫療發展。

三、 活動之質量化指標：

課前問卷統計：參與動機82.72分，專業能力64.00分

課後問卷統計：參與動機90.60分，專業能力91.67分

(一)前測問卷                                                                                

  填答人數：67人

(二) 後測問卷                                                                                      

填答人數：57人

(三) 學員意見回饋：

n   單細胞研究分析的整個經驗分享讓任印象深刻

n   內容教學淺顯易懂，實際操作易讓人印象深刻

n   希望學校能夠購買幾個QIAGEN專業版帳號讓需要的同仁或實驗室在需要做變異位點辨認以及想了解藥物使用建議時能借閱使用，以利增進基因體應用分析

(四)活動花絮：

學員上課畫面

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學員上課畫面-2

學員上課畫面

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