活動名稱

高階研發人才研習營-高階醫藥研發軟體與研究平台實作研習營

活動日期

108年07月17日(星期三)-07月18日(星期四) 、07月24日(星期三)-07月25日(星期四)

活動時間

108/07/17 09：00～18：00

108/07/18 09：00～18：00

108/07/24 09：00～17：30

108/07/25 08：30～18：00

活動地點

本校國研大樓IR334教室、IR209教室

活動參與對象

全校師生

活動參與人數

45人、45人、23人、20人

一、 活動重點及目的：

          7/17~7/18

Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 為目前世界上內容最完整、註解最準確的生物醫學分析研發軟體暨資料庫，目前許多國際藥廠及知名研究機構皆採用IPA

來作為基因體學、蛋白質體學、藥物毒理學、臨床實驗、及代謝與調控路徑等研究之分析與開發工具，至今已輔助許多研究機構發表文獻於知名期刊上，如

Nature、Cancer Research、PNAS等。研究人員可以藉由使用IPA從多個層面整合來自不同omics實驗平台的實驗資料，進而對實驗系統中生物分子間的互動

關係、細胞表型或是疾病發展過程能有更深入的了解。

        7/24

局域表面電漿共振LSPR(Localized Surface Plasmon Resonance)可檢測蛋白質分子之間、藥物與蛋白、抗原與抗體、DNA與蛋白質、核酸與核酸以及受體與

配體等生物分子之間的相互作用。LSPR不只是看分子間是否有結合的關係，更能將分子間的結合關係量化(Affinity, KD)並提供分子結合(KON)及解離(Koff)的

數據。在目前熱門的藥物開發領域，如小分子藥物、標靶藥物等是不可或缺的工具。而在其它領域，如免疫學研究、蛋白研究、食安檢測、材料學等，LSPR也

提供了相當有公信力的佐證。實驗流程相當簡便，不需繁複耗時的標定反應、即時動態監測生物分子間交互作用、約2小時可獲得實驗數據。且在論文發時，

LSPR提供強而有力的輔佐，是使論文內容資料更強大的先進工具，不僅是論文發表，對於許多醫學領域和生醫研究的進展也是必要的。

         7/25

        流式細胞儀的應用日進月益，如何在同一次實驗甚至是同一管樣本中，獲取更多的資訊已成為分析的重點，本次的工作坊將帶學員了解多色配色的原理，如何

        簡單完成實驗設計並且避免配色常見錯誤，練習使用網路資源 GPS (Guide Panel Solution) 簡化配色過程，配色結果也將由學員實際操作與上機分析，期待透

        過課程讓大家掌握多色實驗的技巧，成為研究與實驗的利器。 

二、 活動特色及執行情形：

          7/17~7/18

          此課程共分為二天進行，透過講員由淺入深的講演，希望學員可以充分了解IPA的功用．第一天上午場，主講「IPA原理及以CLC軟體處理NGS資訊」，下午

          場則以「IPA資料庫使用介紹」為主，包含如何查找資訊，如何繪製路徑，及上傳dataset，講員提供每位學員教學帳號，便能逐步帶領學員認識熟悉IPA，更

          能讓學員利用自己的dataset透過資料庫的演算，獲得數據分析結果。

         第二天則是進階課程內容，主題分別為「IPA分析方式及結果意義闡釋」與「利用Omicsoft自有實驗數據與重要公開資料庫提升IPA數據分析能力」，IPA以數

         據演算及人工閱讀的資料庫文獻，提供在千萬筆的研究分析資料中，快速找出最關鍵的生物途徑與分子間的調控關係。

          7/24

         主要介紹最新第二代表面電漿共振技術，學習LSPR儀器之原理，並更進一步介紹儀器對於抗體藥物、小分子藥物開發之應用，除此之外更安排實務操作訓練

          實習課程，讓出席者能親自實務操作CD16a Fc receptor抗體藥物親和力分析實驗，實際上機操作，爾後更進行實務操作之數據分析及問題討論。

         透過這一連串的實驗教學及實際操作後，出席者能學會生物分子間是否有交互作用結合，更將其關係量化並得到分子結合及解離數據。

          7/25

         早上課程分別由張舒婷專員介紹多色實驗優勢、趨勢與設計原理和陳又楷專員介紹螢光特性和Brilliant dye螢光家族，以及其適用時機與數據實例。

         此外，陳又楷專員也與大家分享如何設計多色實驗，以GPS為範例。

         下午課程主要著重在實際操作部分，專員先講解細胞染色細節與技巧，再教學員設計染色控制組與實驗組，讓每位學員都有機會親手操作實驗學習如何染色。

         最後再分組上樣，讓每位學員都能了解螢光補償的原理與重要性，以及如何分析多色樣品來取得正確結果。

三、 活動之質量化指標：

         7/17~7/18

         1.量化：

         課前問卷統計：參與動機81.33分，專業能力69.93分

         課後問卷統計：參與動機88.20分，專業能力90.33分

         2.質化：

         (1)吸收新技能，幫助套用在研究上

         (2)step-by step 上機操作

         (3)軟體實際操作

         7/24

課前問卷統計：參與動機80.23分，專業能力62.12分

課後問卷統計：參與動機88分，專業能力87.1分

         7/25

         1.量化：

課前問卷統計：參與動機85.25分，專業能力81.50分

課後問卷統計：參與動機88.75分，專業能力89.06分

         2.質化：

         (1)老師與助教都很熱心親切回答大家的問題

         (2)課程安排的很好，條理式的讓大家學習多色螢光實驗

         (3)可以增加流式細胞儀進階分析數據的課程